В Томске 85 музеев
Большинствомузеев Томской области находятся в Томске. Здесь действует множество муниципальных и ведомственных музеев, музеев при вузах и школах. Кроме того, в городе действует несколько художественных галерей, выставочных залов в которых проходят выставки томских и иногородних художников, скульпторов, фотографов. Однако так было не всегда. Например, в 1970 году в Томске было всего три музея. Все — специализированные. Сегодня. В 2014 году, в городе 16 специализированных музеев, 27 — при вузах, 27 — при школах и техникумах и 15 — при разных учреждениях.
В конце октября 2007 года в Томске состоялся 1-й музейный форум, участие в котором приняли свыше 70 музеев города и области, в том числе прошло шоу «Ночь в музее».
В Томске нет зоопарка, школьников обычно возят на экскурсии в соседний Северск, где есть Северский зоопарк. Существуют планы по созданию томского зоопарка в Михайловском роще.
Расположен в центре города, на Воскресенской горе, рядом с камнем в честь основания Томска. В собрании музея выделяется коллекция археологических находок, сделанных во время раскопок здесь же, на Воскресенской горе (керамика, костяные стрелы, металлическая "фурнитура" от ворот и другие изделия из металла, пуговицы, в том числе костяные, стеклянные бусы, изразцы и др.). Включает постоянную экспозицию "Первый век Томска", представлен "План-панорама Томска первой четверти XX века, сделанная профессором ТГАСУ Ю.П. Нагорновым". Есть выход на каланчу, с которой открывается великолепный вид города с высоты птичьего полета.